Cumartesi, Nisan 11, 2020

Üç tip Corona Virüs , Orijinali ABD den..

Cambridge Üniversitesi, yeni koronavirüs A tip inin virüs salgınının temel kaynağı olduğunu ve A tipinin ABD ve Avustralya'da ortaya çıktığını ileri süren bir makale yayınladı. Yazıda Wuhan'da ortaya çıkan virüsün , A tipi mutasyonundan türetilen B tipine ait olduğu söyleniyor.

Bu makalenin Amerikan Bilimler Akademisince yayınlanmış olması genel propogandayı çürüten nitelikte. Ayrıca başlangıç tarihinin Eylül ile Aralık arasında olduğu öngörülüyor. Bu öngörü, ilk tespitin 31 Aralıkta Wuhanda olmasına rağmen, hastalığın daha önce başka yerde "var olma" olasılığınıda güçlendiriyor.

Cambridge Üniversitesi, yeni koronavirüsün çeşitli varyantları ve iletim yolları hakkında yayınladığı araştırma raporunda yeni koronavirüsün üç varyanta ayrıldığını söylüyor; A, B, C tipleri. Yapılan araştırmalar A Tipi virüslerin, ABD ve Avustralya'daki enfekte kişilerde daha yaygın olduğunu gösteriyor. Wuhan'da sadece birkaç A tipi vakası var ve bunlar Wuhan'da yaşayan Amerikalılardan geliyor. A tipi daha çok yarasalardan ve pangolinlerden (karınca yiyen hayvan) edilen virüslere benzer. Araştırmacılar A sınıfı virüse "salgının kökü" diyorlar.

B tipi suşlar Çin'deki (yani Wuhandaki) ana tiptir , ve Doğu Asya'dan yayılmamış.

C sınıfı virüsler Avrupa'daki ana tip. Hong Kong, Singapur ve Güney Kore deki virüslerinde hepsi bu tipte. Araştırmalarda bu tip Çin topraklarında bulunamadı.

Araştırmacılar C türü suşun B türünden , B türünün de A' türünden evrildiğine inanıyorlar.

Araştırmacılar tarafından kullanılan araştırma yöntemleri daha önce tarih öncesi insanların DNA araştırması yoluyla hareketini izlemek için kullanılan yöntemmiş. Bu, yeni koronavirüsün yayılma yolunu izlemek için ilk kez kullanılıyor. Bu teknoloji tarih öncesi insan nüfusunun, DNA araştırmalarıyla göçlerini, göç yönlerini haritalamak için kullanılan bir yöntem. EA

Bilimsel dilden anlayanlar için Nisan 8 tarihli Araştırma orjinali, 

Makale

COVID-19: Genetik ağ analizi pandemik kökenlerin 'anlık görüntüsünü' sağlar

Cambridge, İngiltere ve Almanya'dan araştırmacılar, insanlarda COVID-19'un erken “evrimsel yollarını” - Wuhan'dan Avrupa ve Kuzey Amerika'ya bulaşan enfeksiyon olarak - genetik ağ tekniklerini kullanarak yeniden yapılandırdılar.

İlk 160 bütün virüs genomlarını hastalardan sıralandırıp analiz ederek bilim adamları, mutasyonlar yoluyla farklı viral soy yaratan  yeni Koronavirüsün bazı orijinal yayılmasını haritalandırdılar.
“COVID-19 aile ağacını düzgün bir şekilde izlemek için çok fazla hızlı mutasyon var. Tüm olası aile ağaçlarını aynı anda görselleştirmek için bir matematiksel ağ algoritması kullandık. "
“Bu teknikler çoğunlukla tarih öncesi insan popülasyonlarının DNA yoluyla hareketlerini haritalamak için kullanımda biliniyor. Bu yöntemin, COVID-19 gibi bir koronavirüsün enfeksiyon yollarını izlemek için ilk defa  kullanılımlarından biri olduğunu düşünüyoruz. ”
Ekip, 24 Aralık 2019 ve 4 Mart 2020 tarihleri ​​arasında dünyanın dört bir yanından örneklenmiş virüs genomlarından veriler kullandı. Araştırma, COVID-19'un ‘A’, ‘B’ ve ‘C’ olarak etiketledikleri yakından ilişkili soy kümelerinden oluşan üç farklı “varyantını” ortaya çıkardı.

Forster ve meslektaşları  yarasalarda bulunan 'A' tipinin, “orijinal insan virüsü genomu”nun - en yakın COVID-19 tipinin -  Wuhan'da bulunduğunu keşfettiler, ancak şaşırtıcı bir şekilde kentte hakim olan virüs tipi değildi.

Wuhan'da yaşadığı bildirilen Amerikalılarda 'A' nın mutasyona uğramış versiyonları görüldü ve ABD ve Avustralya'dan gelen hastalarda çok sayıda A tipi virüs bulundu.

Wuhan'ın başlıca virüs türü 'B', Doğu Asya'nın dört bir yanındaki hastalarda yaygındı. Bununla birlikte, varyant daha fazla mutasyon olmadan bölgenin çok ötesine gitmedi - yani  Wuhan'da bir "kurucu olay" veya Doğu Asya dışında bu tür COVID-19'a karşı "direniş" i ima ediyor.

'C' varyantı, Fransa, İtalya, İsveç ve İngiltere'de erken hastalarda bulunan başlıca Avrupa türüdür. Araştıramada Çin topraklarından örneklemelerde C tipinin olmadığı, ancak Singapur, Hong Kong ve Güney Kore'de olduğu görülmekte.

Yeni analiz ayrıca, virüsün İtalya'ya ilk girişlerinden birinin 27 Ocak'ta belgelenen ilk Alman enfeksiyonu ile geldiğini ve diğer bir erken İtalyan enfeksiyon yolunun bir “Singapur kümesi” ile ilişkili olduğunu gösteriyor.

Önemli olarak, araştırmacılar genetik ağ oluşturma tekniklerinin yerleşik enfeksiyon yollarını doğru bir şekilde izlendiğini söylüyor: mutasyonlar ve viral soylar bilinen vakalar arasındaki (bilinmeyen) noktaları tamamladı.

Bu nedenle, bilim adamları, bu en yeni koronavirüs genom dizilemesine uygulanan  “filogenetik” yöntemlerin, gelecekteki küresel hastalıkların bulaşma ve dalgalanma sıcak noktalarını tahmin etmeye yardımcı olmak için uygulanabileceğini ileri sürüyorlar.

Cambridge'de Arkeoloji Araştırmaları McDonald Enstitüsü'nün ve aynı zamanda Üniversitenin Sürekli Eğitim Enstitüsünün bir üyesi olan Forster, “Filogenetik ağ analizi, daha sonra dünya çapında hastalığın daha fazla yayılmasını içerecek şekilde sonradan karantinaya alınabilen belgelenmemiş COVID-19 enfeksiyon kaynaklarını belirleme potansiyeline sahiptir” dedi . .

Bulgular bugün Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler dergisinde (PNAS) yayınlandı. Çalışmada kullanılan yazılımın yanı sıra 1000'den fazla koronavirüs genomu ve sayımı için sınıflandırmalara www.fluxus-technology.com adresinden ücretsiz olarak erişilebilir.

Hem yarasalarda hem de pangolinlerde bulunan virüsle en yakından ilişkili olan 'A' varyantı, araştırmacılar tarafından “salgının kökü” olarak tanımlanmaktadır. 'B' tipi, iki mutasyonla ayrılmış 'A' dan türemiş, daha sonra 'C' sırayla 'B' nin “kızı” dır.

Araştırmacılar, 'B' varyantının Doğu Asya'ya lokalizasyonunun “kurucu etkiden” kaynaklanabileceğini söylüyor: bir virüs durumunda, küçük, izole bir enfeksiyon grubundan yeni bir tip kurulduğunda ortaya çıkan genetik bir darboğaz.
Forster, dikkate alınması gereken başka bir açıklamanın olduğunu savunuyor. “Wuhan B tipi virüsü, Doğu Asya nüfusunun büyük bir bölümüne immünolojik veya çevresel olarak adapte olmuş olabilir. Virüsün Doğu Asya dışındaki direnişin üstesinden gelmek için mutasyona uğraması gerekebilir. Bu ilk aşamada, Doğu Asya'da, başka yerlerden daha yavaş bir mutasyon oranı görüyoruz.

“Detaylandırdığımız viral ağ, COVID-19'un evrimsel yollarının çok sayıda mutasyon tarafından gizlenmeden önce, bir salgının erken aşamalarının detaylı bir görüntüsüdür. Bu, aynı  yeni başlayan bir patlamayı anında yakalamak gibi. ”

Bugünün PNAS çalışması, yürütüldüğünden bu yana, araştırma ekibi analizini 1,001 viral genomla genişletti. Henüz değerlendirilmemesine rağmen, Forster, en son çalışmanın COVID-19 ın insanlar arasında ilk enfeksiyon ve yayılmasının Eylül ortası ile Aralık başı arasında gerçekleştiğini gösterdiğini söylüyor.

Araştırmacılar tarafından kullanılan - yüzlerce evrim ağacının aynı anda basit bir grafikte görselleştirilmesini olanaklı kılan -  filogenetik ağ yöntemlerine 1979'da Yeni Zelanda'da öncülük edildi, daha sonra 1990'larda Alman matematikçiler tarafından geliştirildi.

Bu teknikler 1998 yılında yeni PNAS çalışmasının ortak yazarı arkeolog Profesör Colin Renfrew'un dikkatini çekti. Devamında, Renfrew, Cambridge Üniversitesi'nde dünyanın ilk arkeogenetik araştırma gruplarından birini kurdu.


Çeviri
Erdoğan A